5.3.2 Foldit

Foldit jẹ kan lẹwa ìmọ ipe nitori ti o kí kii-amoye lati kopa ninu ona kan ti o jẹ fun.

The Netflix Prize, nigba ti evocative ki o si ko, ko ni akawe ni kikun ibiti o ti ìmọ ipe ise agbese. Fun apẹẹrẹ, ninu awọn Netflix Prize julọ ti awọn pataki awọn alabaṣepọ ní ọdun ti ikẹkọ ni statistiki ati ẹrọ eko. Sugbon, ìmọ ipe ise agbese tun le mudani awọn alabaṣepọ ti o ni ko si lodo ikẹkọ, bi a ti alaworan nipa Foldit, a amuaradagba kika game.

Amuaradagba kika ni awọn ilana nipasẹ eyi ti a pq ti amino acids gba lori awọn oniwe-apẹrẹ. Pẹlu kan ti o dara oye ti yi ilana, biologists le ṣe ọnà rẹ ọlọjẹ pẹlu kan pato ni nitobi ti o le ṣee lo bi oogun. Simplifying oyimbo kan bit, awọn ọlọjẹ ṣọ lati gbe si wọn ni asuwon ti agbara iṣeto ni, a iṣeto ni ti o iwọntunwọnsi ni orisirisi i ati ki o fa laarin awọn amuaradagba (Figure 5.7). Nítorí, ti o ba a awadi fe lati ṣe asọtẹlẹ ohun ti apẹrẹ sinu eyi ti a amuaradagba yoo agbo, awọn ojutu dun o rọrun: o kan gbiyanju gbogbo awọn ti ṣee atunto, ṣe iṣiro wọn okunagbara, ati asọtẹlẹ wipe awọn amuaradagba yoo agbo sinu asuwon ti agbara iṣeto ni. Laanu, yi ṣa ti agbara ona ti o je gbiyanju gbogbo awọn ti ṣee atunto ni computationally soro nitori nibẹ ni o wa ọkẹ àìmọye ati ọkẹ àìmọye ti o pọju awọn atunto. Ani pẹlu awọn alagbara julọ awọn kọmputa wa loni-ati ni lenu ojo iwaju-ṣa ti agbara wa ni o kan ko lilọ lati ṣiṣẹ. Nitorina, biologists ti ni idagbasoke ọpọlọpọ awọn onilàkaye aligoridimu to daradara wa fun awọn ni asuwon ti agbara iṣeto ni. Sugbon, pelu lowo oye akojo ti imo ijinle sayensi ati isiro akitiyan, awon aligoridimu ni o si tun jina lati pipe.

Olusin 5.7: Amuaradagba kika. Aworan ti a da ati ki o gbe sinu gbangba domain nipa "DrKjaergaard". Orisun: Wikimedia Commons .

David Baker ati awọn iwadi re Ẹgbẹ ni University of Washington wà lara awọn awujo ti sayensi ṣiṣẹ lati se agbekale dara isiro yonuso si amuaradagba kika. Ni ibere lati orin ohun ti a ti ṣẹlẹ nigba ti won aligoridimu ti won cranking lọ, Baker rẹ ati awọn ẹgbẹ yoo lẹẹkọọkan wo a iboju-ipamọ ti o visualized awọn ilọsiwaju ti won aligoridimu. Nigba ti wiwo awọn wọnyi riri, Baker bẹrẹ si Iyanu boya o yoo jẹ ṣee ṣe fun awọn èèyàn lati ran ninu awọn ilana, ati bayi bẹrẹ Foldit, a Creative ati ki o lẹwa ìmọ ipe (Hand 2010) .

Foldit wa ni awọn ilana ti amuaradagba kika sinu kan ere ti o le wa ni dun nipa ẹnikẹni. Lati irisi ti awọn ẹrọ orin, Foldit han lati wa ni a adojuru (Figure 5.8). Awọn ẹrọ orin ti wa ni gbekalẹ pẹlu kan onisẹpo mẹta tangle ti amuaradagba be ati ki o le ṣe operations- "tweak", "wiggle", "kọ" -that yi awọn oniwe-apẹrẹ. Nipa sise awọn wọnyi mosi ẹrọ orin yi awọn apẹrẹ ti awọn amuaradagba, eyi ti o ni Tan posi tabi n dinku wọn Dimegilio. Farabale, awọn Dimegilio ti wa ni iṣiro da lori awọn agbara-ipele ti isiyi iṣeto ni; kekere-agbara awọn atunto ja si ni ti o ga ikun. Ni gbolohun miran, awọn Dimegilio iranlọwọ dari awọn ẹrọ orin bi nwọn ti wa fun kekere-agbara awọn atunto. Ere yi jẹ ṣee ṣe nikan nitori-o kan bi asotele movie iwontun-wonsi ninu awọn Netflix Prize-amuaradagba kika jẹ tun kan ipo ibi ti o ti jẹ rọrun lati ṣayẹwo awọn solusan ju ina wọn.

Olusin 5.8: Game iboju fun Foldit.

Foldit ká yangan oniru kí orin pẹlu kekere lodo imo ti Biokemisitiri lati figagbaga pẹlu awọn ti o dara ju aligoridimu apẹrẹ nipa amoye. Nigba ti julọ awọn ẹrọ orin ti wa ni ko paapa ti o dara ni awọn iṣẹ-ṣiṣe, nibẹ ni o wa kan diẹ awọn ẹrọ orin ati kekere egbe ti awọn ẹrọ orin ti o wa ni exceptional. Ni o daju, ni a ori-si-ori idije lati ṣe asọtẹlẹ be ti 10 pato awọn ọlọjẹ, Foldit awọn ẹrọ orin wà anfani lati lu ipinle-ti-ni-aworan amuaradagba kika aligoridimu ni igba marun (Cooper et al. 2010) .

Foldit ati awọn Netflix joju wa ti o yatọ ni ọpọlọpọ awọn ọna, ṣugbọn nwọn mejeji mudani ìmọ awọn ipe fun awọn solusan ti o wa ni rọrun lati ṣayẹwo ju ina. Bayi, a yoo ri kanna be ni sibẹsibẹ miiran gan o yatọ eto: itọsi ofin. Yi ik apẹẹrẹ ti ohun-ìmọ ipe isoro fihan wipe ti won tun le ṣee lo ni eto ti wa ni ko han ni amenable to quantification.