5.3.2 Foldit

فولٹ ایک پروٹین فولڈنگ کھیل ہے جو غیر متخصص افراد کو لطف اندوز کرنے کے قابل بناتا ہے.

Netflix انعام، تشخیص اور واضح کرتے ہوئے، کھلا کال منصوبوں کی مکمل رینج کی وضاحت نہیں کرتا. مثال کے طور پر، Netflix انعام میں بہت سارے شرکاء میں اعداد و شمار اور مشین سیکھنے میں سال کی تربیت تھی. لیکن، کھلا کال منصوبوں میں شرکاء بھی شامل ہوسکتے ہیں جو رسمی تربیت نہیں کرتے، جیسا کہ فولٹ، ایک پروٹین فولڈنگ کھیل کی طرف اشارہ کیا گیا تھا.

پروٹین تہذیب یہ عمل ہے جس کے ذریعہ امینو ایسڈ کی ایک شکل اس کی شکل پر ہوتی ہے. اس عمل کی بہتر تفہیم کے ساتھ، حیاتیات کے ماہرین کو مخصوص سائز کے ساتھ پروٹین ڈیزائن کر سکتے ہیں جو ادویات کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے. کافی تھوڑا سا، پروٹین کو اپنی سب سے کم توانائی کی ترتیب، ایک ترتیب ہے جو مختلف دھاتوں کو بیلنس اور پروٹین کے اندر اندر ھیںچ (5.7 شکل) میں منتقل کرنے کے لئے منتقل کرتے ہیں. لہذا، اگر محققین کو اس شکل کی پیشکش کرنا چاہتی ہے جس میں پروٹین کو ضائع ہو جائے گا، حل آسان لگتا ہے: صرف تمام ممکنہ ترتیبات کی کوشش کریں، ان کی توانائی کا حساب لگائیں، اور پیش گوئی کریں کہ پروٹین سب سے کم توانائی کی ترتیب میں گزر جائے گی. بدقسمتی سے، تمام ممکنہ ترتیبات کی کوشش کرنے کے لحاظ سے ممنوعہ ہے ناممکن ہے کیونکہ وہاں اربوں اور اربوں کے ممکنہ ترتیبات ہیں. یہاں تک کہ آج دستیاب سب سے زیادہ طاقتور کمپیوٹرز اور مستقبل کے برعکس طاقت صرف کام کرنے کے لئے نہیں جا رہا ہے. لہذا، حیاتیات کے ماہرین نے سب سے کم توانائی کی ترتیب کے لئے مؤثر طریقے سے تلاش کرنے کے لئے بہت سے ہوشیار الگورتھم تیار کیا ہے. لیکن، بڑے پیمانے پر سائنسی اور معاشی کوششوں کے باوجود، یہ الگورتھم اب بھی کامل سے دور ہیں.

شکل 5.7: پروٹین تہ. تصویری تعصب "ڈاکٹرججراج" / Wikimedia Commons .

ڈیوڈ بیکر اور واشنگٹن یونیورسٹی کے ان کے ریسرچ گروپ سائنسدانوں کی کمیونٹی کا حصہ تھے جو پروٹین تہ کرنے کے لئے کمپیوٹنگ کے نقطہ نظر کو تخلیق کرتے تھے. ایک منصوبے میں، بیکر اور ساتھیوں نے ایک ایسا نظام تیار کیا جس نے رضاکارانہ طور پر تخروپن پروٹین فولڈنگ کی مدد کے لئے اپنے کمپیوٹرز پر غیر استعمال شدہ وقت عطیہ کرنے کی اجازت دی. بدلے میں رضاکار ایک اسکرینورور دیکھ سکتے ہیں جو پروٹین فولڈنگ اپنے کمپیوٹر پر ہو رہا ہے. ان رضاکاروں میں سے کئی بیکر اور ساتھیوں نے لکھا کہ ان خیالات کا اظہار کرتے ہیں کہ وہ کمپیوٹر کی کارکردگی پر بہتر بن سکتے ہیں اگر وہ حساب میں شامل ہوسکیں. اور اس طرح فولٹ (Hand 2010) شروع ہوا.

فولٹ ایک کھیل میں پروٹین فولڈنگ کی عمل کو بدل دیتا ہے جو کسی کی طرف سے کھیلا جاتا ہے. پلیئر کے نقطہ نظر سے، فولٹ ایک پہیلی (5.8 نمبر) ظاہر ہوتا ہے. کھلاڑیوں کو پروٹین کی ساخت کے تین جہتی طلبا کے ساتھ پیش کیا جاتا ہے اور عملی طور پر "کارکردگی،" "وگول،" "تعمیر" کر سکتے ہیں. ان کارروائیوں کو انجام دینے سے کھلاڑیوں کو پروٹین کی شکل بدلتی ہے، جس میں باری میں اضافہ ہوتا ہے یا کم ہوتا ہے. بنیادی طور پر، سکور موجودہ ترتیب کی توانائی کی سطح پر مبنی ہے. اعلی توانائی کی ترتیب اعلی نتیجہ میں پایا جاتا ہے. دوسرے الفاظ میں، سکور کھلاڑیوں کی رہنمائی میں مدد ملتی ہے کیونکہ وہ کم توانائی کی ترتیبات تلاش کرتے ہیں. یہ کھیل صرف ممکن ہے کیونکہ Netflix انعام یا پروٹین تہ کرنے میں فلم کی درجہ بندی کی پیشکش کی طرح ایسی ایسی صورت حال ہے جہاں ان کو پیدا کرنے کے مقابلے میں حل چیک کرنا آسان ہے.

شکل 5.8: فولڈر کے لئے گیم اسکرین. http://www.fold.it سے اجازت کی طرف سے دوبارہ شروع.

فولٹ کے خوبصورت ڈیزائن کو کھلاڑیوں کو بایو کیمسٹری کے چھوٹے رسمی علم کے ساتھ ماہرین کی طرف سے ڈیزائن کیا گیا بہترین الگورتھم کے ساتھ مقابلہ کرنے کے قابل بناتا ہے. جبکہ زیادہ سے زیادہ کھلاڑی کام میں خاص طور پر اچھی نہیں ہیں، کھلاڑیوں کے چند انفرادی کھلاڑیوں اور چھوٹے ٹیموں جو غیر معمولی ہیں. حقیقت میں، فولڈ کھلاڑیوں اور ریاستی آرٹ الگورتھم کے درمیان سر سے سر مقابلہ میں، کھلاڑی نے 10 پروٹینز میں سے 5 میں سے 5 کے لئے بہتر حل پیدا کیا (Cooper et al. 2010) .

فولٹ اور Netflix انعام بہت سے طریقے سے مختلف ہیں، لیکن وہ حل کے لئے کھلی کال بھی شامل ہیں جو پیدا کرنے کے مقابلے میں چیک کرنے کے لئے آسان ہے. اب ہم اسی ڈھانچے کو ابھی تک ایک اور بہت مختلف ترتیب میں دیکھیں گے: پیٹنٹ قانون. کھلی کال کی دشواری کا یہ حتمی مثال یہ ہے کہ یہ نقطہ نظر اس ترتیبات میں بھی استعمال کی جا سکتی ہے جو واضح طور پر مقدار میں قابل قبول نہیں ہے.