5.3.2 Foldit

ஃபெல்டிட் என்பது ஒரு புரோட்டீன்-மடிப்பு விளையாட்டு ஆகும், அது அல்லாத நிபுணர்கள் நிபுணத்துவம் வாய்ந்த முறையில் பங்கேற்க உதவுகிறது.

நெட்ஃபிக்ஸ் பரிசு, வெளிப்படையான மற்றும் தெளிவான போது, ​​திறந்த அழைப்பு திட்டங்கள் முழு அளவையும் விளக்குவதில்லை. உதாரணமாக, நெட்ஃபிக்ஸ் பரிசில் தீவிர பங்கேற்பாளர்களில் பெரும்பாலானவர்கள் புள்ளிவிவரங்கள் மற்றும் இயந்திர கற்றல் பயிற்சிகளில் பல ஆண்டுகள் பயிற்சி பெற்றனர். ஆனால், திறந்த அழைப்பு திட்டங்கள், முறையான பயிற்சி இல்லாத பங்கேற்பாளர்களையும் உள்ளடக்கியது, இது புரோட்டின்-மடிப்பு விளையாட்டை, ஃபோல்டிட் மூலம் விளக்கப்பட்டுள்ளது.

புரோட்டின் மடிப்பு என்பது அமினோ அமிலங்களின் சங்கிலி அதன் வடிவத்தில் எடுக்கும் செயல். இந்த செயல்முறையை நன்கு புரிந்து கொண்டு, உயிரியலாளர்கள் மருந்துகளை பயன்படுத்தக்கூடிய குறிப்பிட்ட வடிவங்களுடன் புரோட்டீன்களை வடிவமைக்க முடியும். சிறிது எளிமையாக்குவது, புரதங்கள் அவற்றின் மிக குறைந்த-ஆற்றல் கட்டமைப்புக்கு மாறுகின்றன, பல்வேறு நெறிமுறைகளைச் சமன்செய்கின்றன மற்றும் புரோட்டீனுக்குள்ளே இழுக்கின்றன (எண்ணிக்கை 5.7). எனவே, ஒரு புரோட்டீனர் மடிந்திருக்கும் வடிவத்தை கணிக்க விரும்புவதாக ஒரு ஆராய்ச்சியாளர் விரும்பினால், தீர்வு எளிமையானதாக இருக்கும்: அனைத்து சாத்தியமான கட்டமைப்புகளையும் முயற்சி செய்து, அவற்றின் ஆற்றல்களைக் கணக்கிடலாம், மேலும் புரதமானது குறைந்த ஆற்றலை உள்ளமைக்கும் என்று கணிக்கின்றன. துரதிருஷ்டவசமாக, சாத்தியமுள்ள கட்டமைப்புகளை முயற்சி செய்வது கணக்கீட்டு ரீதியாக சாத்தியமற்றதாகும், ஏனெனில் பில்லியன் கணக்கான மற்றும் பில்லியன் கணக்கில் சாத்தியமான கட்டமைப்புகள் உள்ளன. இன்றும் கிடைக்கக்கூடிய மிக சக்தி வாய்ந்த கணினிகளுடனும் கூட, எதிர்காலத்தில்-முரட்டுத்தனமான சக்தியாக வேலை செய்யப் போவதில்லை. ஆகையால், உயிரியலாளர்கள் பல புத்திசாலி நெறிமுறைகளை உருவாக்கியுள்ளனர். ஆனால், அறிவியல் மற்றும் கணிசமான முயற்சிகளின் பாரிய அளவில் இருந்த போதிலும், இந்த நெறிமுறைகள் இன்னும் மிகச் சரியானவை.

படம் 5.7: புரத மடிப்பு. "DrKjaergaard" / விக்கிமீடியா காமன்ஸ் படத்தின் மரியாதை.

டேவிட் பேகர் மற்றும் வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகத்தில் அவரது ஆராய்ச்சி குழு புரோட்டீன் மடிப்புக்கு கணக்கீட்டு அணுகுமுறைகளை உருவாக்க விஞ்ஞானிகள் சமூகத்தின் ஒரு பகுதியாக இருந்தது. ஒரு திட்டத்தில், பேக்கர் மற்றும் சகாக்களும் ஒரு கணினியை உருவாக்கினர், அது தன்னார்வலர்கள் தங்கள் கணினிகளில் பயன்படுத்தப்படாத நேரத்தை வழங்குவதற்கு உருவகப்படுத்துதல் புரத மடிப்புக்கு உதவ அனுமதித்தது. அதற்கு பதிலாக, தொண்டர்கள் தங்கள் கணினியில் நடக்கும் புரத மடிப்பு காட்டும் ஒரு திரைப்பார்வை பார்க்க முடியும். இந்த தொண்டர்கள் பலர் பேக்கரி மற்றும் சக ஊழியர்களிடம், கணக்கில் ஈடுபட முடியுமெனில் அவர்கள் கணினியின் செயல்திறனை மேம்படுத்த முடியும் என்று நினைத்தார்கள். இதனால் ஃபோல்டிட் (Hand 2010) தொடங்கியது.

ஃபுல்ட்ட் புரோட்டின் மடிப்பு செயல்முறையை ஒரு விளையாட்டாக மாற்றியமைக்கிறது, அது யாருக்கும் விளையாட முடியும். வீரரின் கண்ணோட்டத்தில், ஃபோல்டிட் ஒரு புதிர் (படம் 5.8) என்று தோன்றுகிறது. வீரர்கள் புரத கட்டமைப்பின் முப்பரிமாண சிக்கலைக் கொண்டு வழங்கப்படுகின்றனர், மேலும் செயல்பாடுகளைச் செய்ய முடியும் - "மாற்றங்கள்", "விக்கிள்", "மீண்டும்" - அதன் வடிவத்தை மாற்றும். இந்த நடவடிக்கைகளை செயல்படுத்துவதன் மூலம் வீரர்கள் புரதத்தின் வடிவத்தை மாற்றிக் கொள்கிறார்கள், இது அதிகரிக்கிறது அல்லது அவற்றின் மதிப்பைக் குறைக்கிறது. விமர்சன ரீதியாக, தற்போதைய கட்டமைப்பின் ஆற்றலை அடிப்படையாகக் கொண்ட மதிப்பீடு கணக்கிடப்படுகிறது; குறைந்த ஆற்றல் கட்டமைப்புகள் அதிக மதிப்பெண்களில் விளைகின்றன. வேறு வார்த்தைகளில் கூறுவதானால், ஸ்கோர் குறைவான ஆற்றல் கட்டமைப்புகளை தேடுகையில் வீரர்களுக்கு வழிகாட்ட உதவுகிறது. நெட்ஃபிக்ஸ் பரிசு-புரோட்டின் மடிப்புகளில் திரைப்பட மதிப்பீட்டைக் கணிக்கப் போவது போலவே, இந்த விளையாட்டு மட்டுமே சாத்தியமானது, அவற்றை உருவாக்கும் விடயங்களைச் சரிபார்க்க எளிதானது.

படம் 5.8: Foldit க்கான விளையாட்டு திரையில். Http://www.fold.it இலிருந்து அனுமதியினால் மறுபிரசுரம் செய்யப்பட்டது.

ஃபோல்டிட்டின் நேர்த்தியான வடிவமைப்பு வல்லுநர்களால் வடிவமைக்கப்பட்ட சிறந்த வழிமுறைகளுடன் போட்டியிட உயிர் வேதியியலின் சிறிய முறையான அறிவுடன் வீரர்களை இயக்குகிறது. பெரும்பாலான வீரர்கள் பணியில் சிறப்பாக இல்லை என்றாலும், சில தனி நபர்கள் மற்றும் விதிவிலக்கான வீரர்களின் சிறு குழுக்கள் உள்ளன. உண்மையில், ஃபோல்டிட் வீரர்கள் மற்றும் மாநில-ன்-கலை வழிமுறைகளுக்கு இடையே ஒரு தலை-தலை-தலை போட்டியில் வீரர்கள் 10 புரோட்டீன்களில் 5 (Cooper et al. 2010) சிறந்த தீர்வுகளை உருவாக்கியுள்ளனர்.

ஃபெல்டிட் மற்றும் நெட்ஃபிக்ஸ் பரிசை பல வழிகளில் வித்தியாசமாகக் கொண்டுள்ளன, ஆனால் அவை இரண்டும் தீர்வைத் திறப்பதற்கு மிகவும் எளிதான தீர்வைத் தருகின்றன. இப்போது, ​​இன்னொரு வித்தியாசமான அமைப்பில் அதே அமைப்பை நாம் பார்ப்போம்: காப்புரிமை சட்டம். வெளிப்படையான அழைப்பு பிரச்சனைக்கு இந்த இறுதி உதாரணம், இந்த அணுகுமுறை மேலும் அளவீடுகளுக்கு வெளிப்படையாக பொருந்தாத அமைப்புகளில் பயன்படுத்தப்படலாம் என்பதைக் காட்டுகிறது.