5.3.2 Фолдит
Фолдит је леп отворен позив јер омогућава не-стручњаке како би учествовали на начин који је забавно.
Је Нетфлик награда, а подсећа и јасно, не илуструју читав низ отворених пројеката позива. На пример, у Нетфлик награду већина озбиљних учесника је имала година обуке у статистици и машинског учења. Али, пројекти отвореног позива може обухватати учеснике који немају формалну обуку, као што је илустровано Фолдит, протеина преклоп игре.
Протеин фолдинг је процес кроз који ланац амино киселина поприма својим обликом. Боље разумевање овог процеса, биолози могу да дизајнирају протеине са специфичним облицима који се могу користити као лек. Поједностављење доста, протеини имају тенденцију да се креће на најнижи енергетски конфигурације, конфигурацију која балансира различите гура и вуче у протеина (слика 5.7). Дакле, ако истраживач жели да предвиди шта облик у који протеин ће се преклопити, решење звучи једноставно: само покушати све могуће конфигурације, израчунати своју енергију, а предвиђају да ће протеина пута у најнижем конфигурацију енергије. На жалост, овај брутална сила приступ који укључује покушава свим могућим конфигурацијама је рачунски немогућа јер постоје милијарде и милијарде потенцијалних конфигурације. Чак и са најмоћнијих компјутера на располагању данас-а у блиској будућности-бруте форце се једноставно неће радити. Стога, биолози су развили многе паметне алгоритама за ефикасно тражити најнижу конфигурацију енергије. Али, упркос огромним количинама научног и рачунарским напора, ови алгоритми су још увек далеко од савршеног.
Слика 5.7: Протеини склапање. Слика је направљена и стављена у јавни домен са "ДрКјаергаард". Извор: Викимедиа Цоммонс .
Дејвид Бејкер и његова истраживачка група на Универзитету у Вашингтону били део заједнице научника који раде на развоју бољих рачунарске приступе протеина савијања. Да бисте пратили шта се дешава док су њихови алгоритми су окретања далеко, Бејкер и његова група повремено гледа сцреен-савер који визуелизује напредак својих алгоритама. Док гледате ове визуелизације, Бејкер је почео да се питам да ли би било могуће да људи да помогну у процесу, чиме је отпочела Фолдит, креативан и предиван отворени позив (Hand 2010) .
Фолдит претвара процес протеина савијања у утакмици која може играти свако. Из перспективе играча, Фолдит изгледа да је загонетка (слика 5.8). Играчи су представљени са тродимензионалним сплета структуре протеина и може обављати операције- "твеак", "увија", "обнови" То мења свој облик. Би обављање тих послова играчи мењају облик протеина, који у повећава заузврат или смањује њихову оцену. Критички, резултат је израчунат на основу енергетског нивоу у тренутној конфигурацији; ниже енергије конфигурације резултирати вишим резултата. Другим речима, резултат помаже водити играче траже ниско-енергетских конфигурација. Ова игра је само могуће, јер баш као предвиђање филмске оцене у Нетфлик награде протеина савијања је и ситуација у којој је лакше да провери решења него генерисати их.
Слика 5.8: Игра екран за Фолдит.
елегантан дизајн Фолдит омогућује играчима са мало формалног знања биохемије да се такмичи са најбољим алгоритмима дизајниране од стране стручњака. Док већина играча није нарочито добар у задатку, постоји неколико играча и мали тимови од играча који су изузетни. У ствари, у конкуренцији хеад-то-хеад да предвиди структуру од 10 специфичних протеина, Фолдит играчи били у стању да победи стате-оф-тхе-арт протеина Фолдинг алгоритама пет пута (Cooper et al. 2010) .
Фолдит и Нетфлик награда се разликују по много чему, али су оба укључују отворене позиве за решења која су лакше проверити него генеришу. Сада ћемо видети исту структуру у још једној веома различите поставке: патентном закону. Ова финална примјер отвореног проблема позива показује да они могу користити у подешавањима које нису очигледно подложне квантификацију.
