5.3.2 Foldit

Foldit එය විනෝදාත්මක වෙන විදිහට සහභාගි නොවන විශේෂඥයන් හැකියාව නිසා ලස්සන විවෘත කැඳවීමක් වේ.

මෙම Netflix ත්යාගය evocative හා පැහැදිලි වන අතර, විවෘත ඇමතුමක් ව්යාපෘති පූර්ණ පරාසය පෙන්නුම් කරන්නේ නැත. උදාහරණයක් ලෙස, Netflix ත්යාගය තුල බරපතල සහභාගී බොහෝ සංඛ්යා ලේඛන සහ මැෂින් ඉගෙනුම් පුහුණු වසර විය. එහෙත්, විවෘත ඇමතුමක් ව්යාපෘති ද Foldit, ප්රෝටීන නවන ක්රීඩාව මගින් විදහා කළ ලෙස, කිසිදු විධිමත් පුහුණුවක් ඇති සහභාගී සම්බන්ධ කළ හැක.

ප්රෝටීන් නවන ඇමයිනෝ අම්ල දාම එහි හැඩය ගනී ලබන ක්රියාවලිය වේ. මෙම ක්රියාවලිය වඩා හොඳ අවබෝධයක් ඇතිව, ජීව විද්යාඥයන් ඖෂධයක් ලෙස භාවිත කළ හැකි බව විශේෂ හැඩයන් ප්රෝටීන නිර්මාණය විය. ටිකක් විතර සරල කර, ප්රෝටීන් ඔවුන්ගේ අවම ශක්ති වින්යාසය, විවිධ තල්ලු සමබරව හා ප්රෝටීන් (රූපය 5.7) තුල අදින මානකරනය වෙත මාරු වීමට නැඹුරු. ඒ නිසා, පර්යේෂකයකු ප්රෝටීන ගුණයකින් ඇත බවට දේ හැඩය අනාවැකි අවශ්ය නම්, විසඳුම සරල ශබ්ද: යන්තම් හැකි සෑම මානකරණ උත්සාහ කරන්න, ඔවුන්ගේ ශක්තීන් ගණනය, සහ ප්රෝටීන අඩුම ශක්ති මානකරනය වෙත ගුණයකින් කියා සමහරු අනාවැකි පළ කරනවා. අවාසනාවකට මෙන් හැකි මානකරණ බිලියන සහ බිලියන නැති නිසා, හැකි සෑම මානකරණ උත්සාහ ඇතුළත් බව මෙම අති මුර්ග ප්රවේශය පරිගණකමය නොහැකි ය. අද-සහ පෙළඹවූයේ-ෆෝස් ලබා ගත වඩාත්ම බලගතු පරිගණක සමග පවා හුදෙක් වැඩ කිරීමට යන්නේ නැහැ. ඒ නිසා, ජීව විද්යාඥයන් කාර්යක්ෂමව අඩුම ශක්ති මානකරන සෙවීමට බොහෝ දක්ෂ ගණිත ක්රමයක් සංවර්ධනය කර ඇත. එහෙත්, විද්යාත්මක හා පරිගණකමය උත්සාහයක් විශාල ප්රමාණයක් තිබිය දී, මෙම ගණිත ක්රමයක් තවමත් බොහෝ අඩුපාඩුකම් ඇත.

රූපය 5.7: ප්රෝටීන් නවන. රූපය "DrKjaergaard" විසින් මවා ලදී public domain වෙත. මූලාශ්රය: විකිපීඩියා, නිදහස් විශ්වකෝෂය .

වොෂින්ටන් විශ්ව විද්යාලයේ ඩේවිඩ් බේකර් සහ ඔහුගේ පර්යේෂණ කණ්ඩායම ප්රෝටීන් නවන වඩා හොඳ පරිගණකමය ප්රවේශයන් සංවර්ධනය කිරීමට වැඩ විද්යාඥයන් ප්රජාව කොටසක් විය. ඔවුන්ගේ ඇල්ගොරිතම ඉවතට cranking වූ අතර සිදුවන දේ නිරීක්ෂණය කිරීම සඳහා, බේකර් සහ ඔහුගේ කණ්ඩායම ඉඳහිට තම ඇල්ගොරිතම වල ප්රගතිය ගැනීමටද බව තිරය-ඉතුරු නැරඹීමට වනු ඇත. මෙම visualizations බලා අතර, බේකර් මිනිසුන් ක්රියාවලිය තුළ උදව් කිරීම සඳහා එය හැකි වනු ඇති ද යන වග කල්පනා කරමින්, හා ඒ නිසා Foldit, නිර්මාණාත්මක හා ලස්සන විවෘත කැඳවීමක් ආරම්භ (Hand 2010) .

Foldit ඕනෑම කෙනෙකුට විසින් ඉටු කළ හැකි බව ක්රීඩාවක් බවට නවන ප්රෝටීන් ක්රියාවලිය හැරෙනවා. මෙම ක්රීඩකයා ඉදිරිදර්ශනය සිට, Foldit කුතුහලයක් (රූපය 5.8) බව පෙනේ. ක්රීඩකයන් ප්රෝටීන් ව්යුහය ත්රිමාණ කල්ලියේ නිතරග සමග ඉදිරිපත් කරනු ලබන අතර, operations- "tweak", "wiggle" ඉටු කළ හැකිය, එහි හැඩය වෙනස් එනම් "නැවත ගොඩනැඟීම". මෙම මෙහෙයුම් ක්රීඩකයන් හොඳින් ඉටු හැරීම වැඩිවීමක් හෝ ඔවුන්ගේ ලකුණු අඩු වන ප්රෝටීන්, හැඩය වෙනස් කරන්න. තීරනාත්මක ලකුණු වත්මන් සැකසුම් බල ශක්ති මට්ටම මත පදනම්ව ගණනය කරනු ලැබේ; අඩු-ශක්ති මානකරණ ඉහළ ලකුණු යාමයි. වෙනත් වචනවලින් කිවහොත්, ලකුණු ඔවුන් අඩු-ශක්ති මානකරණ සඳහා ගවේශනය ලෙස ක්රීඩකයන් මග උපකාරී වේ. නිසා-හුදෙක් Netflix ත්යාගය ප්රෝටීන් නවන තුළ චිත්රපට වර්ගීකරණයන් අනාවැකි පල වැනි ද ඔවුන් ජනනය වඩා එය විසඳුම් පරීක්ෂා කිරීම වඩාත් පහසු තත්වයක් වන මෙම ක්රීඩාව පමණි.

Figure 5.8: Foldit සඳහා ගේම් තිරයක්.

Foldit ගේ අලංකාර නිර්මාණ විශේෂඥයන් විසින් නිර්මාණය කරන ලද හොඳම ගණිත ක්රමයක් සමඟ තරඟ කිරීමට ජෛව රසායන කුඩා විධිමත් දැනුම සමඟ ක්රීඩකයන් හැකියාව ලැබෙනවා. බොහෝ ක්රීඩකයින් කර්තව්යය දී විශේෂයෙන් හොඳ ය අතරතුර, ක්රීඩකයන් කිහිපයක් සහ සුවිශේෂී සිටින ක්රීඩකයන් කුඩා කණ්ඩායම් තියෙනවා. ඇත්තවශයෙන්ම, කරට විශේෂිත ප්රෝටීන 10 ව්යුහය ගැන අනාවැකි ලබා තරගය තුළ, Foldit ක්රීඩකයන් රාජ්ය නවීන ප්රෝටීන් නවන ඇල්ගොරිතම පස් වතාවක් පරාජය කිරීමට සමත් වූහ (Cooper et al. 2010) .

Foldit සහ සදහා Netflix ත්යාගය බොහෝ ක්රම විවිධ වේ, නමුත් ඔවුන් දෙදෙනාම ජනනය වඩා පරීක්ෂා කිරීමට පහසු වන බව විසඳුම් සඳහා විවෘත ඇමතුම් සම්බන්ධ වේ. පේටන්ට් නීතිය: දැන්, අපි තවත් ඉතා වෙනස් පරිසරයක දී එම ව්යුහය දකිනු ඇත. විවෘත කැඳවීමක් ප්රශ්නය මේ අවසන් උදාහරණය ඔවුන් ද ප්රමාණකරණ නම්යශීලි නොවන බව පැහැදිලිවම සැකසීම් තුළ භාවිතා කළ හැකි බව පෙන්නුම් කරයි.