5.3.2 Foldit

Foldit ڇاڪاڻ ته ان جو هڪ طريقو آهي ته مزي ۾ حصو وٺڻ لاء اهل بڻائي غير جي ماهرن جو هڪ خوبصورت کليل سڏ آهي.

هن Netflix انعام، جڏهن ته evocative ۽ صاف، کليل سڏ منصوبن جي مڪمل حد بيان نه ڪندو آھي. مثال طور، سنڌ جي Netflix انعام ۾ سنجيده ڌرين جي سڀ کان انگ اکر ۽ مشين سکيا ۾ ٽريننگ جو سال هئي. پر، کليل سڏ منصوبن به ڌرين جو، ڪو به رسمي تربيت ڪئي آهي ته جيئن Foldit، هڪ پروٽين تہ راند جي illustrated ويو داخل ڪري سگهو ٿا.

پروٽين تہ عمل جنهن جي وسيلي امينا تيزابي جي هڪ سند ان جي شڪل تي ٿيندڙ آهي. هن عمل جي هڪ ڀلي ڌيان سان، biologists مخصوص شڪلين ته دوا جي طور تي استعمال ٿي سگهي سان پروٽين ڊزائن ڪري سگهي ٿي. ڪافي سا Simplifying، پروٽين سندن زير توانائي جي تشڪيل، هڪ تشڪيل ته مختلف دٻاء بئلينس ۽ پروٽين (شڪل 5.7) اندر pulls کي وڃڻ لاء توکان موڪلائين. پوء، هڪ محقق گوئي کي ڪهڙي شڪل جنهن ۾ هڪ پروٽين لاء وٽيندا ڪندو گھري ته، سنڌ جي حل سادو آوازن: بس، سڀني جي لحاظ کان ترتيبون جي ڪوشش سندن توانائيون حساب، ۽ گوئي ته پروٽين جي زير توانائي جي تشڪيل ۾ ٻٽو ڪندو. افسوس، هن brute طاقت اچڻ ته سڀ ممڪن ترتيبون جي ڪوشش ۾ شامل computationally ممڪن ڇاڪاڻ ته اتي ڊالر ۽ امڪاني ترتيبون جي ڊالر آهي. جيتوڻيڪ سنڌ جي سڀ کان طاقتور موجود ڪمپيوٽرن اڄ-۽ قابل قياس مستقبل-brute طاقت ۾ سان انصاف نه ڪم ڪرڻ وارو آهي. تنهن ڪري، biologists سمورين جي زير توانائي جي تشڪيل تي ڳولھا ڪرڻ لاء ڪيترن ئي ماھر algorithms ٺاهيا آهن. پر، علمي ۽ computational ڪوشش جو تمام وڏا مقدار جي باوجود، انهن algorithms اڃا مڪمل کان پري آهن.

شخصيت 5،7: پروٽين تہ. تصويري "DrKjaergaard" جي پيدا ۽ عوام جي ڊومين ۾ رکيل هئي. ذريعو: Wikimedia Commons .

واشنگٽن يونيورسٽي ۾ دائود Baker ۽ سندس تحقيق جي گروپ پروٽين تہ لاء ڀلو computational اچي ترقيء لاء ڪم سائنسدانن جي ساٿ جو حصو هئا. امان کي ٽريڪ ڪرڻ لاء جيڪي جڏهن ته سندن algorithms پري cranking هئا اچڻ ويو ع ۾، Baker ۽ سندس ٽولو ڪڏهن ڪڏهن هڪ اسڪرين-بچائندڙ سندن algorithms جو سلسلو جاري آهي visualized ته ڏسي ها. انهن visualizations ڏسي رهيا هئاسين، Baker لڳو ته ڇا ان انسان جي عمل ۾ مدد ڪرڻ لاء ممڪن ٿي سگهندي شروع ڪيو، ۽ اھڙي طرح Foldit، هڪ تخليقي ۽ خوبصورت کليل سڏ لڳو (Hand 2010) .

Foldit ڪنهن جي ادا ٿي سگهي ٿو ته هڪ راند ۾ تہ پروٽين جي عمل ڦرندو. جي رانديگر جي ڪانه کان، Foldit هڪ puzzle (شڪل 5.8) ٿي نظر اچن ٿا. رانديگرن، پروٽين جوڙجڪ جي هڪ ٽي-dimensional tangle سان پيش ڪري رهيا آهن ۽ operations- "tweak"، "wiggle" انجام ڪري سگهن ٿا "خداوند" آڇيون ان جي شڪل ۾ تبديل ڪري. انهن عملن جي رانديگرن سرانجام قسم جي پروٽين، جنهن موڙ وڌائي ۾ يا سندن ايڊليڊ گھڻي قدر جي شڪل ۾ تبديل ڪري. تنقيدي، جي ايڊليڊ: موجوده تشڪيل جي توانائي-سطح جي بنياد تي ڏوهه آهي. هيٺين-توانائي ترتيبون اعلي متاثر جي نتيجي ۾. ٻين لفظن ۾، جي ايڊليڊ ته جيئن اهي گهٽ-توانائي ترتيبون لاء تلاش جي رانديگرن کي سڌو رستو ۾ مدد ڪري. هن جو شڪار رڳو ممڪن آهي، ڇاڪاڻ ته-بس به هڪ صورتحال جتي اها پهچ آهي حل چيڪ ڪرڻ جي ڀيٽ ۾ کين پيدا ڪيو آهي ته Netflix انعام-پروٽين تہ ۾ فلم درجابندي predicting وانگر.

شخصيت 5.8: Foldit لاء گيم اسڪرين.

Foldit جي خوبصورت ڊزائن ماهرن جي ٺهيل بهترين algorithms سان پورو ڪرڻ biochemistry جو ٿورو رسمي علم سان رانديگرن بڻائي ٿو. جڏهن ته سڀ کان وڌيڪ رانديگرن جي ڪم ۾ خاص طور تي سٺو نه آهي، نه ڪنهن کي ڪجهه بنيادي ۽ رانديگرن جو ھجيس آھن جي ننڍي ٽيمن آهن. حقيقت ۾، هڪ سر-کي-سر مقابلو 10 خاص پروٽين جي جوڙجڪ گوئي ۾، Foldit رانديگرن رياست-جي-جي-فن پروٽين تہ algorithms پنج ڀيرا مات ڪرڻ جي قابل هئا (Cooper et al. 2010) .

Foldit ۽ Netflix انعام ڪيترن ئي طريقن ۾ مختلف آهن، پر اهي ٻئي حل آهي ته پيدا کان چيڪ ڪرڻ آسان آهي لاء کليل مطالبن داخل. روشن قانون: هاڻي، اسان کي اڃان تائين ٻئي بلڪل مختلف لھڻ ۾ به ساڳئي جوڙجڪ ڏسندين. هڪ کليل سڏ مسئلي جي هن آخري مثال ڏيکاري ٿو ته اھي به جوڙ آهي ته ڏٺل quantification کي amenable نه آهن ۾ استعمال ڪري سگهجي ٿو.