5.3.2 Foldit

Foldit ده یو ښکلی خلاص غوښتنې ته ځکه چې دا غیر کارپوهانو وړتیا ورکوي چې په داسې يوه لاره ده چې د تفريح کې ګډون وکړي.

د Netflix جایزې، په داسې حال کې evocative او روښانه، نه د پرانیستو غوښتنې ته د پروژو د بشپړ حدودو تشریح. د مثال په توګه، په Netflix جایزې د جدي ګډونوالو تر ټولو په ارقامو او ماشيني زده کړې روزنې کلونو درلود. خو، خلاص غوښتنې پروژو هم ګډون لري چې د رسمي زده کړې يې نه، په توګه له خوا Foldit، يو پروټين تاوېدو لوبه توضيح کې ښکیلې دي.

د پروټین تاوېدو د بهير له لارې چې د امينو اسيدونو يو ځنځير په خپل شکل مهمه ده. د دې پروسې د ښه پوهه سره، بيولوجستان سره مشخص شکلونه چې کېدای شي درمل وکارول شي پروټينو سره طرحه کړي. خورا يو څه ساده، پروټينونو ميلان لري چې د خپلو ټولو ټیټه انرژي سازونې، يو سازونې چې د بېلابېلو لپاره هڅې ترمينځ تعادل او د پروتين (5.7 شکل) په چوکاټ کې را وباسی حرکت. نو که يو څېړونکی غواړي وړاندوینه څه شکل ته چې د پروتين به قات ته، د حل ساده غږونو: يوازې د ټولو ممکنه بڼې هڅه، د خپلو انرژيو محاسبه، او وړاندوینه چې د پروتين به ټیټه انرژي سازونې راغی. له بده مرغه، دغه صفته قوت سره چلند چې د اوسم ټولو ممکنه بڼې هڅه کوي له کمپيوټر څخه ناشونی دی ځکه چې هلته ملیاردونو او بالقوه بڼې ميلياردونو دي. آن تر ټولو ځواکمن کمپيوټرونه شتون سره نن-او په نژدې راتلونکي کې-صفته قوت يوازې نه به کار وکړي. له همدې امله، بيولوجستان ډېر هوښیار algorithms پراختيا ته په اغیزمنه توګه د ټیټ انرژۍ د سازونې لپاره لټون وکړي. خو، د علمي او محاسبې هڅې پراخه اندازه سره سره، دغو algorithms دي لا هم د ژر تر ژر تر اوسه.

انځور 5.7: د پروټین تاوېدو. د انځور جوړ شو او د "DrKjaergaard" ځاي چې دعامه استعمال. سرچینه: د Wikimedia Commons لخوا .

ډیویډ بیکر او د واشنګټن د پوهنتون د هغه ډلې چې د پوهانو کار کوي تر څو د پروټينو تاوېدو ښه محاسبې سم تګلاري تهيه او د ټولنې يوه برخه ده. د دې لپاره چې تعقیب کړي چې څه پېښه په داسې حال کې د خپلو algorithms شوي cranking لرې، بیکر او د هغه ډله به کله ناکله يوه پرده-خوندي کونکی چې د خپلو algorithms د پرمختګ visualized د لیدو لپاره. په داسې حال کې د دغو visualizations ګوري، بیکر پيل حيران چې آیا دا به ممکنه وي د انسانانو لپاره چې په دغه پروسه کې مرسته وکړي، او په دې توګه Foldit، یو نوښتګر او ښايسته خلاص غوښتنې پيل (Hand 2010) .

Foldit د پروتين تاوېدو د بهير په يوه لوبه چې کولای شي د چا له خوا ترسره تاويږي. څخه د لوبغاړي له نظره، Foldit ښکاري چې یوه معما (5.8 شکل) وي. لوبغاړو سره د پروتين جوړښت دری بعدي د داخپليدو لپاره وړاندې کيږي او کولی شي د عملیات ترسره "tweak"، "wiggle"، "ودان" تفسیرونه خپل شکل ته بدلون ورکړي. د دغو عملیاتو په ترسره کولو لوبغاړو د پروتين د شکل بدلون، چې په خپل وار د زياتوالي او یا د هغوی نمرې کم شی. مهمه دا ده، چې د نمرې محاسبه پر بنسټ د اوسني سازونې د انرژۍ په کچه؛ ټیټ انرژۍ د بڼې په لوړو نمرو سبب شي. په بل عبارت، د نمرو سره مرسته کوي چې دوی د ټیټ انرژۍ بڼې پلټنه د لوبغاړو الرښوونه کوي. دا لوبه يوازې ممکنه ده ځکه-په څېر په Netflix جایزې پروټيني تاوېدو فلم درجه وړاندوینه هم يوه حالت کې چې یې دا دی چې په پرتله يې توليد د حل لارې وګورئ اسانه ده.

انځور 5.8: د Foldit لوبه پرده.

Foldit د اجزاو څخه ډیزاین سره د ژونکيميا لږ رسمي پوهه لوبغاړو وړتیا ورکوي چې په سم او درست algorithms کارپوهانو له خوا طرح سره سيالي وکړي. په داسې حال کې تر ټولو لوبغاړو په ځانګړې توګه ښه په کار نه دي، د يو څو لوبغاړو او کوچنۍ ډلې د هغه لوبغاړي چې استثنا شتون لري. په حقیقت کې، د يوه مشر-to-مشر سیالۍ د 10 ځانګړو پروټينونو د جوړښت وړاندوینه په، Foldit لوبغاړي کولای شول چې پنځه ځله د دولت-of-د-هنر پروتين تاوېدو algorithms ته ماتې ورکړه (Cooper et al. 2010) .

Foldit او Netflix جایزې دي په ډېرو لارو توپير لري، خو د دواړو لپاره د حل لارې دي چې اسانه وګورئ څخه تولید خلاص غوښتنې په کې ښکیلې دي. د امتیاز د حق د قانون: اوس، مونږ به په بله ډېر توپير ماحول ورته جوړښت وګورئ. د يوه غږ ستونزه دا وروستۍ بيلګه په ګوته کوي چې هغوی هم په Setting ته چې څرګنده دي quantification چمتووالی نه کارول شي.