5.3.2 Foldit

तो न-तज्ञ मजा आहे की एक प्रकारे सहभागी सक्षम होते कारण Foldit एक सुंदर उघडा कॉल आहे.

Netflix पुरस्कार जागृत करणारा आणि स्पष्ट असताना, खुल्या कॉल प्रकल्प संपूर्ण स्पष्ट नाही. उदाहरणार्थ, Netflix पुरस्कार गंभीर सहभागी सर्वात आकडेवारी आणि मशीन शिक्षण प्रशिक्षण वर्षे होते. पण, खुल्या कॉल प्रकल्प, नाही औपचारिक प्रशिक्षण आहे Foldit, एक प्रथिन गोलाकार खेळ करून स्पष्ट होते म्हणून सहभागी ध्वनित करू शकता.

प्रथिने गोलाकार amino ऍसिडस् साखळी आकार घेते जे प्रक्रिया आहे. ही प्रक्रिया चांगल्या प्रकारे समजून सह, जीवशास्त्रज्ञ औषध म्हणून वापरले जाऊ शकते असे विशिष्ट आकार प्रथिने डिझाइन शकते. थोडा सोपे, प्रथिने, त्यांच्या नीचांकी ऊर्जा संरचना, विविध नाही संतुलन आणि प्रथिन (आकृती 5.7) आत धावा संरचना हलवण्यासाठी कल. त्यामुळे, एक संशोधक काय आकार मध्ये एक प्रथिन दुमडणे होईल हे कोणालाच सांगता करू इच्छित असल्यास, उपाय सोपे ध्वनी: फक्त सर्व शक्य संरचना प्रयत्न, त्यांची शक्ती गणना, आणि प्रथिनं सर्वात कमी ऊर्जा व्यूहरचनेत दुमडणे होईल की भाकित. दुर्दैवाने, सर्व शक्य संरचना प्रयत्न यांचा समावेश आहे की, या दुष्ट शक्ती दृष्टिकोन करण्याचे अशक्य आहे कोट्यवधी आणि संभाव्य संरचना कोट्यवधी आहेत कारण. अगदी उपलब्ध सर्वात शक्तिशाली संगणक आज-आणि foreseeable भविष्यात-दुष्ट शक्ती फक्त काम करणार नाही. म्हणून, जीवशास्त्रज्ञ कार्यक्षमतेने सर्वात कमी ऊर्जा संरचना शोधण्यासाठी अनेक हुशार अल्गोरिदम विकसित केली आहे. पण, वैज्ञानिक व संगणकीय प्रयत्न भव्य प्रमाणात असूनही, या अल्गोरिदम अजूनही परिपूर्ण पासून लांब आहे.

आकृती 5.7: प्रथिने गोलाकार. प्रतिमा निर्माण आणि "DrKjaergaard" सार्वजनिक डोमेन मध्ये आणण्यात आले. स्रोत: विकिपीडिया .

डेव्हिड बेकर आणि वॉशिंग्टन विद्यापीठात आपल्या संशोधन गट प्रथिने गोलाकार चांगले संगणकीय पध्दती विकसित करण्यासाठी कार्यरत शास्त्रज्ञ समुदायाचा एक भाग होते. त्यांच्या अल्गोरिदम दूर cranking असताना काय ट्रॅक करण्यासाठी, बेकर आणि त्यांचा ग्रुप कधीकधी पडदा-सेव्हर त्यांच्या अल्गोरिदम प्रगती दृश्यमान पाहण्यासाठी होईल. या व्हिज्युअलायझेशन पाहताना, बेकर मानव प्रक्रियेत मदत करण्यासाठी शक्य होईल की नाही हे आश्चर्य वाटू लागले, आणि अशा प्रकारे Foldit, एक सर्जनशील आणि सुंदर उघडा कॉल सुरुवात केली (Hand 2010) .

Foldit कोणालाही द्वारे खेळला जाऊ शकतो की एक खेळ मध्ये प्रथिने गोलाकार प्रक्रिया करते. खेळाडू दृष्टीकोनातून, Foldit एक कोडे (आकृती 5.8) असल्याचे दिसून येते. खेळाडू प्रथिने रचना एक त्रिमितीय गुंतागुंतीची अवस्था सादर करण्यात आणि "चिमटा", "वळवळ", operations- सुरू अर्थात "पुन्हा तयार" त्याचे आकार बदलू शकता. या ऑपरेशन करून खेळाडू, प्रोटीन आकार बदलू वळण वाढते किंवा त्यांचा स्कोअर कमी आहे. बारकाईने, धावसंख्या गणना चालू संरचना ऊर्जा-स्तरावर आधारित आहे; कमी-ऊर्जा संरचना अधिक गुण होतात. दुसऱ्या शब्दांत, धावसंख्या खेळाडू मार्गदर्शन ते कमी ऊर्जा संरचनाकरीता शोध म्हणून मदत करते. देखील त्यांना निर्माण पेक्षा उपाय तपासण्यासाठी सोपे आहे जेथे परिस्थिती आहे Netflix पुरस्कार प्रथिने गोलाकार चित्रपट रेटिंग भाकीत सारखे फक्त कारण-हा खेळ फक्त शक्य आहे.

आकृती 5.8, कारण Foldit गेम स्क्रीन.

Foldit च्या मोहक रचना तज्ञ रचना सर्वोत्तम अल्गोरिदम स्पर्धा जीवरसायनशास्त्र थोडे औपचारिक ज्ञान खेळाडू सक्षम करते. सर्वात खेळाडू कार्य विशेषतः चांगला नाही असताना, अपवादात्मक आहेत खेळाडू काही खेळाडू आणि लहान संघ आहेत. खरे म्हणजे, 10 विशिष्ट प्रथिने रचना अंदाज एक डोके-ते-डोके स्पर्धेत, Foldit खेळाडू राज्य-ऑफ-द-आर्ट प्रथिने गोलाकार अल्गोरिदम पाच वेळा विजय सक्षम होते (Cooper et al. 2010) .

Foldit आणि Netflix बक्षीस अनेक भिन्न आहेत, पण ते दोन्ही निर्माण पेक्षा तपासण्यासाठी सोपे आहेत उपाय खुल्या कॉल समावेश. पेटंट कायदा: आता, आम्ही आणखी एक अतिशय भिन्न सेटिंग मध्ये समान रचना दिसेल. खुले कॉल समस्या या अंतिम उदाहरण ते देखील जाहीरपणे quantification अंमलात नाहीत सेटिंग्ज मध्ये वापरले जाऊ शकते असे दर्शवितो.