5.3.2 Foldit

Foldit ass eng schéin Opruff well et Net-Experten erméiglecht an engem Wee fir matzemaachen, dass Spaass ass.

D'Netflix Präis, iwwerdeems komlizéierte a kloer, dat Ganzt net der ganzer Palette vun Opruff Projeten. Zum Beispill, an der Netflix Prix meescht vun de schlëmmen Participanten haten Joer vum Training zu Statistiken an Maschinn Léieren. Mä, kann Opruff Projeten och Participanten bezitt déi keng formell Ausbildung hunn, wéi déi vun Foldit illustréiert huet, e Protein folding Spill.

Protein folding ass de Prozess, duerch dat eng Kette vun Aminosaier Saieren op seng Form kritt. Mat engem bessere Verständnis vun dësem Prozess, konnt biologists Design Proteinen mat spezifesche Aarten déi als Medezin benotzt ginn hätt. Vereinfacht nawell e bëssen, éischter Proteinen ze hire niddregsten Energie Configuratioun ze plënneren, eng Configuratioun, datt déi verschidde Spuerpak Solden a begeeschtert bannent d'FAQ (Dorënner 5.7). Also, wann e Fuerscher ze soe wëll wat Form an deem e FAQ fantastesch gëtt, Toun- der Léisung einfach: just all méiglech Konstellatioun probéieren, rechent hir Energien, an viraus, datt d'FAQ an de niddregsten Energie Configuratioun fantastesch gëtt. Leider, dat inverse Approche, déi all méiglech Konstellatioun doranner versichen ass computationally onméiglech well do Milliarden a Milliarden vun Potential Konstellatioun sinn. Och mam mächtegsten Computeren sinn haut-a vun der absehbarer Zukunft-inverse ass just elo un Aarbecht net. Dofir, hun biologists vill clever algorithms entwéckelt effizient fir de niddregsten Energie Configuratioun ze sichen. Mä trotz Quantitéiten vun wëssenschaftlechen an computational Effort, sinn dës algorithms nach wäit vun perfekt.

Figur 5,7: Protein folding. Bild gouf geschaf an Faarwe nees Public Domain vun "DrKjaergaard". Source: Wikimedia Commons .

David Baker a seng Fuerschung Grupp op der Universitéit vu Washington waren Deel vun der Communautéit vun de Wëssenschaftler schaffen besser computational Approche zu FAQ folding ze entwéckelen. Fir wat ze Streck war geschitt iwwerdeems hir algorithms fort waren cranking, Baker a sengem Grupp wär en Écran-opsetzen heiansdo souguer, dass de Fortschrëtt vun hire algorithms visualized. Während dësen visualizations kucken, ugefaang Baker ze wonneren, ob et méiglech wier fir Mënschen an de Prozess ze hëllefen, an domat ugefaang Foldit, enger kreativer a schéin Opruff (Hand 2010) .

Foldit ëmdréit de Prozess vun FAQ folding an engem Spill, dat vun jidderengem gespillt gin kann. Aus der Perspektiv vun de Spiller, schéngt Foldit engem Puzzel (Dorënner 5.8) ze ginn. Spiller si mat enger dräi-Dimensiounen géingen vun FAQ Struktur virgestallt a kann Leeschtunge operations- "Owend", "Wiggle", "opzebauen" -that seng Form änneren. Vun enger performanter änneren dës Operatiounen Spiller d'Form vun der FAQ, wat dann geet oder hir stoung Verloschter. Kritesch, ass de Ball baséiert op der Energie-Niveau vun der aktueller Configuratioun berechent; niddreg-Energie Konstellatioun Resultat an héich stin. An anere Wierder, hëlleft stoung de Spiller Guide wéi se fir niddreg-Energie Konstellatioun Sich. Dëst Spill ass nëmme méiglech, well-just Film Bewäertungen am Netflix Prix-FAQ folding ass och eng Situatioun wéi en wou et ass einfach Léisungen ze kucken, wéi se produzéiert.

Figur 5.8: Spill Écran fir Foldit.

Foldit d'elegant Design erméiglecht Spiller mat klenge formelle Wëssen vun Biochimie mat de beschte algorithms vun Experten entworf ze rivaliséieren. Iwwerdeems déi meescht Spiller an der Aufgab net besonnesch gutt sinn, et sinn e puer Spiller a klengen Equipen vu Spiller déi aussergewéinlech sinn. An Tatsaach, an engem Kapp-ze-Chef Concours der Struktur vu 10 spezifeschen Proteinen ze soe, goufen Foldit Spiller kënnen ze liichtfäerteg ofgeschloss Staat-vun-der-Konscht FAQ folding algorithms fënnef Mol (Cooper et al. 2010) .

Foldit an der Netflix Präis sinn verschidden an vill Méiglechkeeten, mä si Urecht zwee oppe fuerdert fir Léisungen, déi einfach ze kucken wéi erstallt ginn. Patentwiesen: Elo, wäerte mir déi selwecht Struktur an nach aner ganz verschiddene Kader gesinn. Dëst Finale Beispill vun enger Opruff Problem weist, datt se och an Astellunge benotzt kënne ginn, dass et net selbstverständlech atomar quantification sinn.