5.3.2 Foldit

Foldit banga bedew vekirî ye, ji ber ku ew ne-pispor, derfetê ji bo beşdarbûna di rê ye ku fun.

Xelata Netflix, dema kurtenavê û zelal, ku di rêzeka giştî ya projeyên banga vekirî biriyan ne. Ji bo nimûne, di Xelata Netflix piraniya beşdaran cidî salan ji perwerdeya li statistics û fêrbûna reşaş de hebûn. Lê belê, projeyên banga vekirî dikare bi beşdarên ku xwedî Tu perwerdeya fermî, ku ji aliyê Foldit, a game protein, folding bike wêneyî hat dimeşînin.

folding Protein pêvajoya ku bi zincîreke ji asîdên amînoyî digire li gorî wê ye. Bi têgihiştineke baştir ya vê pêvajoyê, Biyologên nikaribû proteînan bi şêweyên taybetî ku dikare weke derman tê bikaranîn design. Yekkirina gelekî bit, proteînan de mêldarê ku koçî lowest veavakirina enerjiya xwe, a veavakirina ku rengên ji vegotina cuda û mekîneyek di nava proteîna (Figure 5.7). Îcar, eger lêkolîner dixwaze ku texmîn bikin ku shape nav ku proteîna bipêçî, çareseriya dengên danê: tenê hewl hemû configurations gengaz, dihejmêrin, enerjîya xwe, û pêşbînîkirin, ku proteîna wê di nav lowest veavakirina enerjiyê li hev bipêçî. Mixabin, vê nêzîkatiya hêzên brute ku maneyeke hewl dide hemû configurations gengaz computationally ne mimkun e ji ber ku bi milyaran û bi milyaran configurations potansîyel heye. Even bi kompûterê herî xurt available îro-û di nava vê hêzê de bi şertê ku pêşeroja-brute tam diçûn ne ji bo xebatê. Ji ber vê yekê, Biyologên gelek algorîtmayên bi qurnazî pêşxistin, ji bo baþtir ji bo lowest veavakirina enerjiyê bigere. Lê belê, tevî ku mîqdarên mezin ên hewldaneke zanistî û computational, van algorîtmayên in hê dûr ji perfect.

Figure 5.7: Protein, folding bike. Wêne hat û nav qada gelemperî de ji aliyê "DrKjaergaard" danîn. Source: Li Wikimedia Commons .

David Baker û koma lêkolîna xwe a li Zanîngeha Washington beşek ji civatê ji zanyar kar ji bo pêş helwestên computational baştir ji bo folding proteîna bûn. Ji bo ku wan bişopîne çi diqewime dema ji algorîtmayan xwe dûr cranking bûn, Baker û koma wî caran dê screen-saver ku ji pêşketina algorîtmayên xwe visualized watch. Gava ku temaşe van xuyakirinên, Baker dest pê kir, gelo dê mumkun be ku mirov ji bo alîkariyê di vê pêvajoyê de, û bi vî awayî dest pê kir Foldit, banga afirîner û bedew vekirî (Hand 2010) .

Foldit rû pêvajoya folding proteîn di nav a game, ku dikare ji aliyê kesekî lîstin. Ji perspektîfa ji player, Foldit xuya bibe puzzle (WÊNE 5.8). Players bi bi tangle sê-rehendî yên avahiya proteîna kirin û diNarin operations- "tweak", "(Bilprovningen)", "ava bike" îstîhbaratê şiklê xwe biguherîne. By bicîhanîna van operasyonan lîstikvanên guhertina shape of the protein, ku li dora zêdekirina an jihevkirî wan kêm dike. Açar ku, di encama giştî li ser bingeha-dereca enerjîyê yên veavakirina niha tê hejmartin; configurations kêmtir-enerjiyê di çendin holê. Bi gotineke din, di dereceyeke alîkarîya rêber ji lîstikvanên ku ew ji bo forumê-enerjiya kêm lêgerîn. Ev lîstik e, tenê ji ber ku-just like encama ratings movie di Netflix folding Xelata-protein e jî, rewşeke ku bi hêsanî kontrol çareseriyên ji bo bipêşxistina wan e.

Figure 5.8: Game screen bo Foldit.

design elegant Foldit ya lîstikvanên bi zanîna fermî piçûk ên biochemistry dihêle ku di pêşbirkê de bi ya herî baş ji algorîtmayan dîzaynkirin, ji aliyê pispor. Demekê de ku piraniya lîstikvanên li karekî bi taybetî jî baş ne, ne çend lîstikvan û tîmên biçûk ya lîstikvanên ku awarte hene. Di rastiyê de, di pêşbirka head-to-head ku pêşbînî li ser avahiya 10 proteîn taybetî, players Foldit nikare xist, dewlet-ji-the-art algorîtmayên folding proteîna pênc car bûn (Cooper et al. 2010) .

Foldit û xelata Netflix bi gelek awayan cuda ne, lê ew her du jî tevlî bangên vekirî ji bo çareseriyê ku bi hêsanî jî ji bo bipêşxistina. qanûna patent: Niha, em dê heman binyata li yet din pir cuda mîhengê bibînin. Ev mînaka dawî ya ku pirsgirêka banga vekirî nîşan dide ku ew jî dikare li settings ku ne eşkere tesîr li quantification ne bên bikaranîn.