5.3.2 Foldit

Foldit ಒಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್-ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಆಟವಾಗಿದ್ದು, ಅದು ವಿನೋದಮಯ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸಲು ತಜ್ಞರಲ್ಲದವರನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.

ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿ, ಎಬ್ಬಿಸುವ ಮತ್ತು ಸ್ಪಷ್ಟವಾದರೂ, ತೆರೆದ ಕರೆ ಯೋಜನೆಗಳ ಪೂರ್ಣ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ವಿವರಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಗಂಭೀರವಾಗಿ ಪಾಲ್ಗೊಳ್ಳುವವರಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನವರು ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಯಂತ್ರ ಕಲಿಕೆಯಲ್ಲಿ ವರ್ಷಗಳ ತರಬೇತಿ ಪಡೆದರು. ಆದರೆ, ಓಪನ್ ಕರೆ ಯೋಜನೆಗಳು ಭಾಗವಹಿಸುವವರಿಗೆ ಔಪಚಾರಿಕ ತರಬೇತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಫೊಲ್ಟಿಟ್ನಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಆಟವು ಇದನ್ನು ವಿವರಿಸಿದೆ.

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಇದರ ಮೂಲಕ ಒಂದು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಸರಣಿ ಅದರ ಆಕಾರವನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಉತ್ತಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ, ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಔಷಧಿಗಳಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದಾದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಆಕಾರಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಬಹುದು. ಸ್ವಲ್ಪಮಟ್ಟಿಗೆ ಸರಳಗೊಳಿಸುವಂತೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕಡಿಮೆ-ಶಕ್ತಿಯ ಸಂರಚನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ (ಫಿಗರ್ 5.7) ಒಳಗೆ ವಿವಿಧ ತಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಎಳೆಯುವ ಒಂದು ಸಂರಚನೆ. ಹಾಗಾಗಿ, ಒಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪದರಕ್ಕೆ ಆಕಾರವನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಸಂಶೋಧಕರು ಬಯಸಿದರೆ, ಪರಿಹಾರವು ಸರಳವಾಗಿದೆ: ಕೇವಲ ಎಲ್ಲಾ ಸಂಭಾವ್ಯ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ, ಅವುಗಳ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಿ, ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕಡಿಮೆ-ಶಕ್ತಿಯ ಸಂರಚನೆಗೆ ಮಡಚಿ ಎಂದು ಊಹಿಸಿ. ದುರದೃಷ್ಟವಶಾತ್, ಎಲ್ಲಾ ಸಂಭಾವ್ಯ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವುದು ಗಣನೀಯವಾಗಿ ಅಸಾಧ್ಯವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಶತಕೋಟಿ ಮತ್ತು ಶತಕೋಟಿ ಸಂಭಾವ್ಯ ಸಂರಚನೆಗಳು ಇವೆ. ಇಂದು ಲಭ್ಯವಿರುವ ಅತ್ಯಂತ ಶಕ್ತಿಯುತ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗಳ ಜೊತೆಗೆ-ಭವಿಷ್ಯದಲ್ಲಿ ಭವಿಷ್ಯದಲ್ಲಿ-ವಿವೇಚನಾರಹಿತ ಶಕ್ತಿ ಕೆಲಸ ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಕಡಿಮೆ ಬುದ್ಧಿವಂತ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಆದರೆ, ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣದ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಮತ್ತು ಗಣನೀಯ ಪ್ರಯತ್ನದ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ಈ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳು ಇನ್ನೂ ಪರಿಪೂರ್ಣವಾಗಿಲ್ಲ.

ಚಿತ್ರ 5.7: ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ. "ಡ್ರೆಜೆರ್ಗಾರ್ಡ್" / ವಿಕಿಮೀಡಿಯ ಕಾಮನ್ಸ್ನ ಚಿತ್ರ ಕೃಪೆ.

ವಾಷಿಂಗ್ಟನ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದಲ್ಲಿ ಡೇವಿಡ್ ಬೇಕರ್ ಮತ್ತು ಅವರ ಸಂಶೋಧನಾ ಗುಂಪು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವಿಕೆಯ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರದ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು ಕೆಲಸ ಮಾಡುವ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳ ಸಮುದಾಯದ ಭಾಗವಾಗಿತ್ತು. ಒಂದು ಯೋಜನೆಯಲ್ಲಿ, ಬೇಕರ್ ಮತ್ತು ಸಹೋದ್ಯೋಗಿಗಳು ಸಿಂಪ್ಯುಲೇಷನ್ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡಲು ಸ್ವಯಂಸೇವಕರು ತಮ್ಮ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಕೆಯಾಗದ ಸಮಯವನ್ನು ದಾನ ಮಾಡಲು ಅನುಮತಿಸುವ ಒಂದು ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದರು. ಪ್ರತಿಯಾಗಿ, ಸ್ವಯಂಸೇವಕರು ತಮ್ಮ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ನಲ್ಲಿ ನಡೆಯುತ್ತಿರುವ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು ತೋರಿಸುವ ಸ್ಕ್ರೀನ್ ಸೇವರ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಬಹುದು. ಈ ಸ್ವಯಂಸೇವಕರು ಹಲವಾರು ಬೇಕರ್ ಮತ್ತು ಸಹೋದ್ಯೋಗಿಗಳಿಗೆ ಬರೆದರು, ಗಣಕಯಂತ್ರದ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಗೆ ಅವರು ಗಣನೀಯವಾಗಿ ತೊಡಗಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದಾದರೆ ಅವುಗಳು ಸುಧಾರಿಸಬಹುದೆಂದು ಅವರು ಆಲೋಚಿಸುತ್ತಾರೆ. ಹೀಗೆ ಫೊಲ್ಡಿಟ್ (Hand 2010) .

ಫೋಲ್ಡಿಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಡಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಯಾರನ್ನಾದರೂ ಆಡಬಹುದಾದ ಆಟಕ್ಕೆ ತಿರುಗುತ್ತದೆ. ಆಟಗಾರನ ದೃಷ್ಟಿಕೋನದಿಂದ, ಫೋಲ್ಡಿಟ್ ಒಂದು ಪಝಲ್ನಂತೆ ಕಂಡುಬರುತ್ತಾನೆ (ಚಿತ್ರ 5.8). ಆಟಗಾರರನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯ ಮೂರು-ಆಯಾಮದ ಸಿಕ್ಕುಗಳಿಂದ ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಆಕಾರವನ್ನು ಬದಲಿಸುವ "ಕಾರ್ಯಾಚರಣೆಯನ್ನು", "ತಿರುಗಿಸು," "ಹುಳು", "ಮರುನಿರ್ಮಾಣ" ಮಾಡಬಹುದು. ಈ ಕಾರ್ಯಾಚರಣಾ ಆಟಗಾರರು ಪ್ರದರ್ಶನ ನೀಡುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಆಕಾರವನ್ನು ಬದಲಿಸುತ್ತಾರೆ, ಅದು ಅವರ ಸ್ಕೋರ್ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ವಿಮರ್ಶಾತ್ಮಕವಾಗಿ, ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಂರಚನೆಯ ಶಕ್ತಿಯ ಮಟ್ಟವನ್ನು ಆಧರಿಸಿ ಅಂಕವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ; ಕಡಿಮೆ ಶಕ್ತಿಯ ಸಂರಚನೆಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಕೋರ್ಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಬೇರೆ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, ಆಟಗಾರರು ಕಡಿಮೆ-ಶಕ್ತಿಯ ಸಂರಚನೆಗಳಿಗಾಗಿ ಹುಡುಕುತ್ತಿರುವಾಗ ಸ್ಕೋರ್ ಮಾರ್ಗದರ್ಶನ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿ-ಪ್ರೊಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಚಲನಚಿತ್ರದ ರೇಟಿಂಗ್ಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುವಂತೆಯೇ ಸಹ ಈ ಆಟವು ಸಾಧ್ಯವಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವುಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುವುದಕ್ಕಿಂತಲೂ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸುವುದು ಸುಲಭವಾಗಿದೆ.

ಚಿತ್ರ 5.8: ಫೋಲ್ಡಿಟ್ಗಾಗಿ ಗೇಮ್ ಪರದೆಯ. Http://www.fold.it ರಿಂದ ಅನುಮತಿಯಿಂದ ಮರುಪ್ರಕಟಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ.

Foldit ನ ಸೊಗಸಾದ ವಿನ್ಯಾಸವು ತಜ್ಞರು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಿದ ಉತ್ತಮ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಸ್ಪರ್ಧಿಸಲು ಜೀವರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರದ ಸ್ವಲ್ಪ ಔಪಚಾರಿಕ ಜ್ಞಾನವನ್ನು ಆಟಗಾರರಿಗೆ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಟಗಾರರು ಕಾರ್ಯದಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಒಳ್ಳೆಯವರಾಗಿರದಿದ್ದರೂ, ಕೆಲವೊಂದು ವೈಯಕ್ತಿಕ ಆಟಗಾರರು ಮತ್ತು ಅಸಾಧಾರಣ ಆಟಗಾರರ ಸಣ್ಣ ತಂಡಗಳು ಇವೆ. ವಾಸ್ತವವಾಗಿ, ಫೋಲ್ಡಿಟ್ ಆಟಗಾರರು ಮತ್ತು ರಾಜ್ಯ-ಕಲೆಯ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳ ನಡುವಿನ ತಲೆ-ಟು-ತಲೆ ಸ್ಪರ್ಧೆಯಲ್ಲಿ, ಆಟಗಾರರು 10 ಕ್ಕಿಂತ 5 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ (Cooper et al. 2010) ಉತ್ತಮ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸಿದ್ದಾರೆ.

ಫೋಲ್ಡಿಟ್ ಮತ್ತು ನೆಟ್ಫ್ಲಿಕ್ಸ್ ಬಹುಮಾನವು ಹಲವು ವಿಧಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿವೆ, ಆದರೆ ಅವುಗಳು ಪರಿಹಾರಕ್ಕಾಗಿ ತೆರೆದ ಕರೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಈಗ, ನಾವು ಅದೇ ರಚನೆಯನ್ನು ಮತ್ತೊಂದು ವಿಭಿನ್ನ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ನೋಡುತ್ತೇವೆ: ಪೇಟೆಂಟ್ ಕಾನೂನು. ಮುಕ್ತ ಕರೆ ಸಮಸ್ಯೆಯ ಈ ಅಂತಿಮ ಉದಾಹರಣೆಯು ಈ ವಿಧಾನವನ್ನು ಸಹ ಪರಿಮಾಣಕ್ಕೆ ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಅನುಗುಣವಾಗಿಲ್ಲದ ಸೆಟ್ಟಿಂಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಸಬಹುದೆಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.