5.3.2 Foldit
Foldit egy szép nyílt felhívás, mert lehetővé teszi a nem részt vevő szakértők oly módon, hogy szórakoztató.
A Netflix, miközben hangulatos és tiszta, nem illusztrálják teljes körű nyílt felhívás projektek. Például a Netflix a legtöbb súlyos résztvevők éves képzés a statisztika és a gépi tanulás. De, nyílt pályázati projektek is résztvevőivel, akik nem rendelkeznek formális oktatást, jól érzékelteti Foldit, a fehérjék térszerkezetének játék.
Fehérje feltekeredés az a folyamat, amelynek révén egy lánc aminosavak veszi az alakját. A jobb érthetőség kedvéért a folyamat, biológusok tudják tervezni fehérjék sajátos formái, hogy fel lehetne használni, mint gyógyszert. Egyszerűsítése egy kicsit, fehérjék mozognak a legalacsonyabb energia konfiguráció, konfiguráció, amely egyensúlyt teremt a különböző gombnyomás, és húzza a protein (5.7 ábra). Tehát, ha a kutató azt akarja megjósolni, hogy mi forma, amelyre a fehérje bedobja, a megoldás egyszerűen hangzik: próbáld az összes lehetséges, számítani energiáikat, és azt jósolják, hogy a fehérje szeres a legalacsonyabb energiájú konfigurációt. Sajnos, ez a brute force megközelítés, amely magában foglalja megpróbálja az összes lehetséges számításigényes lehet, mert vannak olyan több milliárd potenciális konfigurációkat. Még a legerősebb számítógépek ma elérhető-és a belátható jövőben, brute force csak nem fog működni. Ezért biológusok kifejlesztett számos okos algoritmusok hatékonyan keresni a legalacsonyabb energiájú konfigurációt. De annak ellenére, hogy hatalmas mennyiségű tudományos és időt igényel, ezek az algoritmusok még messze nem tökéletes.
5.7 ábra: Protein összecsukható. A kép jött létre, és helyezzük nyilvánosság által "DrKjaergaard". Forrás: Wikimedia Commons .
David Baker és kutatócsoportja a University of Washington volt a közösség részeként dolgozó tudósok, hogy jobb számítási megközelítések protein folding. Annak érdekében, hogy nyomon, hogy mi történik, miközben a algoritmusokat próbálkozás el, Baker és csapata időnként megnézni egy képernyővédő, amely láthatóvá előrehaladásával algoritmusok. Miközben nézi ezeket képi, Baker kezdett tűnődni, hogy vajon lehetséges lenne az emberek számára, hogy segítse a folyamatot, és így kezdett Foldit, kreatív és szép nyílt felhívást (Hand 2010) .
Foldit fordul a folyamat protein folding egy játék, amely játszható bárki. Szemszögéből a játékos, Foldit tűnik, hogy egy puzzle (5.8 ábra). A játékosok együtt jelennek meg egy háromdimenziós kusza fehérjék szerkezetének és végre operations- "csípés", "kígyózik", "újraépítése" -Ez változtatja az alakját. Elvégzésével a műveleteket a játékosok változtatni az alakját a fehérje, ami viszont növeli vagy csökkenti a pontszámot. Kritikusan, a pontszám alapján kerül kiszámításra az energia-szintet a jelenlegi konfiguráció; alacsonyabb energiájú konfigurációt eredményez magasabb pontszámot. Más szóval, az érték segít irányítani a játékosokat, mert keresni alacsony energiájú konfigurációt. Ez a játék csak azért lehetséges, mert-mint előre film alapján a Netflix-protein folding is olyan helyzet, ahol könnyebb ellenőrizni megoldások, mint létre ezeket.
5.8 ábra: A játék képernyőjén Foldit.
Foldit elegáns kialakítás lehetővé teszi a játékosoknak, kevés formális tudás biokémia versenyezni a legjobb algoritmusokat amelyet szakértők. Míg a legtöbb játékos nem különösebben jó a feladat, van néhány játékos, és a kis csapat a játékosok, akik a rendkívüli. Tény, hogy egy fej-fej verseny megjósolni a szerkezet a 10 specifikus fehérjék, Foldit játékosok képes legyőzni state-of-the-art fehérje feltekeredési algoritmusok ötször (Cooper et al. 2010) .
Foldit és a Netflix is sok tekintetben különböző, de mindketten vonják nyílt felhívások megoldásokat, amelyek könnyebb ellenőrizni, mint generál. Most fogjuk látni ugyanazt a struktúrát még egy egészen más környezetben: szabadalmi jog. Ez az utolsó példa a nyílt felhívás problémát mutatja, hogy akkor is lehet használni a beállításokat, amelyek nyilvánvalóan nem alkalmasak a mennyiségi meghatározásra.
