5.3.2 Foldit

Foldit કારણ કે તે એક માર્ગ છે કે જે મજા ભાગ માટે સક્રિય કરે છે બિન નિષ્ણાતના એક સુંદર ઓપન કોલ છે.

Netflix પુરસ્કાર, જ્યારે evocative અને સ્પષ્ટ, ઓપન કોલ પ્રોજેક્ટ સંપૂર્ણ શ્રેણી સમજાવે નથી. ઉદાહરણ તરીકે, Netflix પ્રાઇઝ ગંભીર સહભાગીઓ મોટા ભાગના આંકડા અને મશીન શિક્ષણ તાલીમ વર્ષ હતી. પરંતુ, ઓપન કોલ પ્રોજેક્ટ પણ સહભાગીઓ જે કોઈ ઔપચારિક તાલીમ હોય છે, કારણ કે Foldit, પ્રોટીન ફોલ્ડિંગ રમત દ્વારા સચિત્ર આવી હતી સમાવેશ કરી શકે છે.

પ્રોટીન ફોલ્ડિંગ પ્રક્રિયા છે, જેના દ્વારા એમિનો એસિડ એક સાંકળ તેના આકાર પર લઈ જાય છે. આ પ્રક્રિયા એક સારી સમજ સાથે, જીવવિજ્ઞાનીઓ ચોક્કસ આકાર કે દવા તરીકે ઉપયોગ કરી શકે છે સાથે પ્રોટીન ડિઝાઇન કરી શકે છે. ખૂબ થોડી સરળ, પ્રોટીન તેમના સૌથી નીચા ઊર્જા રૂપરેખાંકન, રૂપરેખાંકન વિવિધ રન નોંધાયો નહીં સંતુલિત અને પ્રોટીન (આકૃતિ 5.7) અંદર બનાવ્યા પર જવા માટે હોય છે. તેથી, એક સંશોધક આગાહી શું આકાર કે જે એક પ્રોટીન વાળી લેશે માંગે છે, તો ઉકેલ સરળ લાગે છે: માત્ર બધા શક્ય રૂપરેખાંકનો પ્રયાસ કરો, તેમના ઊર્જા ગણતરી, અને આગાહી કે પ્રોટીન સૌથી નીચો ઊર્જા રૂપરેખાંકન માં લઈ છાતીએ લગાડવું પડશે. કમનસીબે, આ જડ બળ અભિગમ સમાવેશ થાય છે કે જે બધી શક્ય રૂપરેખાંકનો પ્રયાસ કરી ગણતરીની અશક્ય અબજો અને સંભવિત રૂપરેખાંકનો અબજો છે, કારણ કે છે. પણ સૌથી શક્તિશાળી ઉપલબ્ધ કમ્પ્યુટર્સ સાથે આજે અને નજીકના ભવિષ્યમાં જડ બળ માત્ર કામ ચાલે છે. તેથી, જીવવિજ્ઞાનીઓ અસરકારક રીતે સૌથી નીચો ઊર્જા રૂપરેખાંકન શોધવા માટે ઘણા હોંશિયાર ગાણિતીક નિયમો વિકસાવી છે. પરંતુ, વૈજ્ઞાનિક અને કોમ્પ્યુટેશનલ પ્રયાસ મોટા પ્રમાણમાં હોવા છતાં, આ ગાણિતીક નિયમો હજુ પણ સંપૂર્ણ દૂર છે.

આકૃતિ 5.7: પ્રોટીન ફોલ્ડિંગ. છબી બનાવી અને "DrKjaergaard" દ્વારા જાહેર ડોમેન માં મૂકવામાં આવ્યું હતું. સોર્સ: Wikimedia Commons નો ભાગ .

ડેવિડ બેકર અને યુનિવર્સિટી ઓફ વોશિંગ્ટન ખાતે તેમના સંશોધન જૂથ પ્રોટીન ફોલ્ડિંગ સારી કોમ્પ્યુટેશનલ અભિગમ વિકસાવવા માટે કામ કરતી વૈજ્ઞાનિકોની સમુદાય ભાગ હતા. ઓર્ડર ટ્રેક કરવા માટે શું બની રહ્યું હતું, જ્યારે તેમની ગાણિતીક નિયમો દૂર cranking કરવામાં આવી હતી, બેકર અને તેમના જૂથના ક્યારેક ક્યારેક સ્ક્રીન બચતકારની તેમની ગાણિતીક નિયમો પ્રગતિ જોવાય છે કે ઘડિયાળ છે. આ વિઝ્યુલાઇઝેશંસ જોવાનું જ્યારે, બેકર આશ્ચર્ય છે કે શું તે માણસો પ્રક્રિયામાં મદદ કરવા માટે શક્ય હશે શરૂ કર્યું, અને આમ Foldit, સર્જનાત્મક અને સુંદર ઓપન કોલ શરૂ કર્યું (Hand 2010) .

Foldit કોઈને દ્વારા રમી શકાય છે કે એક રમત માં પ્રોટીન ફોલ્ડિંગ પ્રક્રિયા કરે છે. પ્લેયર ઓફ પરિપ્રેક્ષ્ય પ્રતિ, Foldit એક પઝલ છે (આકૃતિ 5.8) હોય તેવું લાગે છે. ખેલાડીઓ પ્રોટીન માળખું ત્રણ પરિમાણીય ગૂંચ સાથે રજૂ કરવામાં આવે છે અને ઑપરેશનોથી કરી શકો છો "વારંવાર હાલવું" "ઝટકો", "પુનઃબીલ્ડ" એટલે તેનો આકાર બદલી. આ કામગીરી પ્રદર્શન કરીને ખેલાડીઓ પ્રોટીન આકાર બદલવા, બદલામાં વધારો અથવા તેમના સ્કોર ઘટે છે. ભારે, સ્કોર વર્તમાન રૂપરેખાંકન ઊર્જા સ્તર પર આધારિત ગણતરી કરવામાં આવે છે; ઓછા ઊર્જા રૂપરેખાંકનો ઉચ્ચ સ્કોર પરિણમે છે. અન્ય શબ્દોમાં, સ્કોર, કારણ કે તેઓ ઓછી ઊર્જા રૂપરેખાંકનો માટે શોધ ખેલાડીઓ માર્ગદર્શન મદદ કરે છે. આ રમત જ શક્ય છે, કારણ કે-માત્ર પણ એક પરિસ્થિતિ જ્યાં તે તેમને પેદા કરતાં ઉકેલો તપાસો સરળ છે Netflix પ્રાઇઝ પ્રોટીન ફોલ્ડિંગ ફિલ્મ રેટિંગ્સ આગાહી જેવી.

આકૃતિ 5.8: રમત Foldit માટે સ્ક્રીન.

Foldit ભવ્ય ડિઝાઇન નિષ્ણાતો દ્વારા રચાયેલ શ્રેષ્ઠ ગાણિતીક નિયમો સાથે સ્પર્ધા કરવા માટે બાયોકેમિસ્ટ્રી થોડી ઔપચારિક જ્ઞાન સાથે ખેલાડીઓ સક્રિય કરે છે. જ્યારે મોટા ભાગના ખેલાડીઓ કાર્ય ખાસ કરીને સારી નથી, ત્યાં અમુક ખેલાડીઓ અને ખેલાડીઓ નાના ટીમો જે અસાધારણ છે. હકીકતમાં, એક વડા-થી-વડા સ્પર્ધા 10 ચોક્કસ પ્રોટીન માળખું આગાહી કરવા માટે, Foldit ખેલાડીઓ રાજ્ય ની-માટે-કલા પ્રોટીન ફોલ્ડિંગ ગાણિતીક નિયમો પાંચ વખત હરાવ્યું માટે સક્ષમ હતા (Cooper et al. 2010) .

Foldit અને Netflix ઇનામ ઘણી રીતે અલગ છે, પરંતુ તેઓ બંને ઉકેલો પેદા કરતાં ચેક કરવા માટે સરળ છે માટે ખુલ્લા કોલ્સ સમાવેશ થાય છે. પેટન્ટ કાયદો: હવે, આપણે હજુ સુધી અન્ય ખૂબ જ અલગ સેટિંગ જ માળખું જોવા મળશે. એક ઓપન કોલ સમસ્યા આ અંતિમ ઉદાહરણ બતાવે છે કે તેઓ પણ સેટિંગ્સ કે જે દેખીતી રીતે માત્રામાં માટે જવાબદાર નથી ઉપયોગ કરી શકો છો.