5.3.2 Foldit

Foldit hè un ghjocu di pruggettu cù u prugettu chì permette chì non-sperteci participanu dun modu chì hè divertitu.

U Premiu Netflix, mentre evucativu è chjaru, ùn illustra a scena larga di prughjetti di chjamate aperti. Per esempiu, in u Prix Netflix a maiò parte di i participanti seriu anu avutu anni di furmazione in statìstichi è in l'impiegazione magna. Ma, i prughjetti di chjamate aperti pò ancu implicà participanti chì ùn anu micca furmazione formale, cum'è l'illustratu Foldit, un ghjocu di pruggettu pattu.

U plegaginu di a Protezia hè u prucessu per quale una catena di aminòciddi tocca à a so forma. Cù una megliazione di stu prucessu, i biologi puderanu disignà e prutezione cù formule specifichi chì pò esse usatu cum'è medicina. Simplificà un pocu, e pruteanu a prutezzione di a so cunfigurazione di a energia più bassa, una cunfigurazione chì saldeghja i varie puseri è tira in a prutetta (figura 5,7). Allora, se un ricerca voli predichjà a forma in quale a prutezza di una proteina, a suluzione sguardi simile: pruvate tutte e vostre cunfigurazioni possittite, calculate e so energii, è predice chì a proteini pruteghja in a cunfigurazione di energia più baxu. Sfortunatamente, pruvà tutte e vostre cunfigurazione pussibili hè cumplicatu impossibile, perchè ci sò milioni e bilioni di cunfigurazione potenzale. Ancu ma l'ordinateur più putenti chì dispunibile oghje è in u futuru prevale, a forza bruta ùn hè micca solu per travaglià. Cusì, i biologi anu sviluppatu assai algoritmi intelligenti per a ricerca effetivamente di a cunfigurazione d'energia più bassa. Ma, anche ammuntarii massivi di sviluppu scientificu è computational, questi algoritmi sò ancu luntanu da perfetta.

Figura 5.7: Pruggillu di a proteina. Foto cortese di "DrKjaergaard" / Wikimedia Commons .

David Baker è u so gruppu di ricerca in l'Università di Washington fôru parti di a cumunità di i scientifichi chì travagliani à creà avvicinamenti cumpatibili à plegari di prutezzione. In un prughjettu, Baker è i culleghi svilupparu un sistema chì permette à i vuluntari à donate u tempu inutilizatu in i so cumpagni per aiutà plectrali di prutezzione di simulazione. In ritornu, i vuluntarii puderà vede un salvapantante chì mostra u plegamentu di a prutezzione chì era succidendu nantu à l'urdinatore. Parechji voluntieri anu scrittu à Baker è i collegues chì dicenu chì i pinsamenti chì puderanu esse migliurà nantu à u funziunamentu di l'informatica s'ellu si puderanu intervene à u calculu. Cusì hà iniziatu Foldit (Hand 2010) .

Foldit gira u prucessu di pruteziu plegu à un ghjocu chì pò esse ghjucatu di qualcunu. Da a perspettiva di u prugressu, Foldit hè un trenu (figura 5.8). I attenti sò prisentati cun una intruduce tridimensionale di struttura di prutezione è ponu realizà l'operazione "ricerca", "manicheggia", "ricustruisce", chì cambia a so forma. Per esse sti operatorii di l'operatore cambienu a forma di a prutezione chì, in su turnu, aumenta o diminisci a so score. A critica, u puntu hè calculatu nantu à u livellu energicu di a cunfigurazione attuale; a cunfigurazioni di energia più bassa in cunsiglii più altas. In altri palori, a partita contru à guidà l'attuttori cumu prupone una cunfigurazione di bassa energia. Stu ghjocu hè solu pussibule, perchè cumu per avè avvisu puntu di scummje in u prugettu di u Prix di Netflix, hè una situazione induve hè più faciule di verificà e solu solu chì l'avianu generatu.

Figura 5.8: Pantalla di Scatula per Foldit. Ripruttata per u permessu di http://www.fold.it.

U prugettu elegutu di Foldit permette à i ghjurnuttori cù pocu sapienze formale di biochemistry per cumpetenu cù i megliie algoritmi di circomi. Mentre a maiò parte di i giochi ùn sò micca particularmenti boni à a so cumpagnia, ci sò qualchi ghjucatorii individuali è i piccule small teams of players that are exceptional. In fattu, in una cumpetenza di primura pè i prupietà Foldit è l'algoritmi state-of-the-art, i jugatori crearu megliu solu per 5 di 10 proteini (Cooper et al. 2010) .

Foldit è u prublemu Netflix sò diverse in parechni maneri, ma i duie implicanu invistiti chjamati solu di suluzioni chì sò più faciuli di verificà chì generate. Avà, avemu a vidiri a stissa struttura in un altru ambientu assai diferenti: u lege di patent. L'ultimu esempiu di un problema di chjamate apertu ne mostra chì questu stigghiu pò ancu esse usatu in i paràmetri chì ùn sò micca obbligatamenti rispettu à quantificazione.